MSSプロジェクトの計算機環境

ファイルサーバー、コンパイル、ジョブの投入

  • ebi
ebi [172.16.2.201, 10.249.84.174] (clovertown-2.66MHzx2, Ram8GB, Cashe8MB)
    DISK: 4.5TB Raid6 (750GB x 8), OS: CentOS 4.4
    コンパイラ: Intel C++, Fortran
    数値計算ライブラリ: Intel MKL (Cluster Edition)
    並列計算ライブラリ: Intel MPI, Cluster OpenMP
    ジョブコントロール: GridEngine [ [[HowTo:https://supcom.hgc.jp/japanese/utili_info/manual/sge.html]] ]

計算ノード

  • tako
tako00 [172.16.2.20, 10.249.84.173] (harpertown-3.00MHzx2, Ram16GB, Cashe12MB)
tako01 [172.16.2.21] (clovertown-3.00MHzx2, Ram16GB, Cashe8MB)
tako02 [172.16.2.22] (clovertown-3.00MHzx2, Ram16GB, Cashe8MB)
tako03 [172.16.2.23] (clovertown-3.00MHzx2, Ram16GB, Cashe8MB)
tako04 [172.16.2.24] (clovertown-3.00MHzx2, Ram16GB, Cashe8MB)
tako05 [172.16.2.25] (clovertown-3.00MHzx2, Ram16GB, Cashe8MB)
tako06 [172.16.2.21] (harpertown-3.00MHzx2, Ram16GB, Cashe12MB)
tako07 [172.16.2.22] (harpertown-3.00MHzx2, Ram16GB, Cashe12MB)
tako08 [172.16.2.23] (harpertown-3.00MHzx2, Ram16GB, Cashe12MB)
tako09 [172.16.2.24] (harpertown-3.00MHzx2, Ram16GB, Cashe12MB)
tako0a [172.16.2.25] (harpertown-3.00MHzx2, Ram16GB, Cashe12MB)

共通計算機の使用マニュアル

tako**へのジョブの投入

Intelコンパイラのバージョンアップメモ

  • C++ for Linux、Fortran for Linux、Cluster Tool Kit for Linuxをインストールする。
  • /opt/intel/i*.*shを確認し、最新版に正しくリンクを張り直す。このファイルは各ノードの/etc/profile.d/i*.*shからシンボリックリンクが貼られており、ログイン時に自動的にbash、cshに反映される。

新規ユーザーを追加する

  • ebiでスーパーユーザになり以下を実行。
   # /usr/sbin/useradd USERNAME
   # passwd USERNAME
   # cd /var/yp; make

NISの設定

  • ebiはNISのプライマリサーバー
   NISドメイン: jstcrestmss
   NISサーバー(Primary): ebi: 10.249.84.174, 172.16.2.201
   NISサーバー(Secondary): tako: 10.249.84.173, 172.16.2.20

NFSの設定

  • ebi:/homeは10.249.84.0/255.255.255.0に対してNFSマウントを許可している。
  • ebiとホームディレクトリを共有にしたければクライアントマシンでNFSの設定を行う。

SAMBA

  • Workgroup => HYMD
  • ウインドウズマシンからパスワードなしでファイルを参照したければSambaにパスワードを登録する。
   SWATによる設定 [WWW]
   ウインドウズマシンからファイルを参照したければ、
   SWAT->PASSWARD->ローカルマシンのパスワード管理->新規ユーザー追加